手持式實時頻譜分析儀的采用無縫處理，采集數據的同時在后臺做大量的運算，數據處理的速度遠大于數據采集的速度，可一次性對整個信號進行快速處理。當處理速度大于采集速度的時候，可以保證在一直采集信號的同時，頻譜儀也能對采集到的信號進行處理，不存在遺漏信號的問題。實時頻譜分析儀并不是在所有的設置下都可以實現無縫處理，當信號都設置得比較大的時候，有可能導致數據采集時間小于數據處理時間，這種情況下實時頻譜分析儀無法工作在無縫處理模式。

　　傳統頻譜儀采用的FFT：采集信號-處理-顯示。在頻譜儀對數據進行處理的時候，這段時間內是采集不到信號的，信號遺漏的概率很大。

　　手持式實時頻譜分析儀有兩種控制功能可以調節靈敏度：基準電平和解析帶寬。挑戰在于，在空中進行測量時，基準電平必需保持得相當高，這樣在測量所有RF能量時，頻譜分析儀才不會過載。在大多數頻譜分析儀中，控制功能會根據用戶配置的頻寬自動設置。在OTA測量中，應降低RBW值，以查看可能影響受擾接收機的小信號。這種組合導致大多數電池供電的頻譜分析儀的掃描速率非常低，也就是說，其不可能看到導致干擾的小的間歇性瞬態信號。